Hi,
1.
Wie sind die Liefermethoden konfiguriert? Ist z.B irgendwo "Preis pro Artikel anwenden" aktiviert?
Warum/wozu brauchst du Lagerhäuser?
Hast du einen Screenshot von der Liste der Liefermethoden, und einen vom Setup einer Liefermethode?
Da deine Liefermethoden und -kosten scheinbar von gewissen Bedingungen abhängen, müsste man schon mehr darüber wissen. Was wann, und was wann nicht, etc.
2.
Du sagst, "zeigt es mir bei einem Produkt den Versand an, bei allen anderen nicht". Wo? Deine Screenshots sehen nach Checkout aus, zeigen aber bloß einen kleinen Teil (Warenkorb). Wenn sie im Checkout nicht angezeigt = dem Kunden zur Auswahl angeboten werden, dann hast du wahrscheinlich den Block "Lieferung" in der System-Config -> Kasse nicht in der Kaufabwicklung.
3.
"Wenn ich Gewicht und Größe des Briefes eintrage"... was für ein Brief? Wo hast du was eingetragen? Sorry, aber kein Ahnung was du meinen könntest.